Leagues and Clubs of Estonia1999
Meistriliiga (1. League)
- 1. Maardu Levadia
- 2. Viljandi Tulevik
- 3. Tallinna Flora
- 4. Narva Trans
- 5. TVMK Tallinn
- 6. Tallinna Lantana
- 7. Lelle SK
- 8. Jõhvi Eesti Põlevkivi
Esiliiga (2. League)
- 1. FC Kuressaare
- 2. Kohtla-Järve Lootus
- 4. FC Valga
- 5. MC Tallinn
- 6. FC Maardu
- 7. FC Lelle
- 8. Sillamäe Kalev
II. liiga ida/põhi (3. League)
- 1. Tallinna Dünamo
- 2. Tallinna Štrommi
- 3. Kiviõli Irbis
- 4. Narva Baltika
- 6. Kohtla-Järve Alko
II. liiga lõuna/lääs (3. League)
- 1. Tartu Merkuur
- 2. Kärdla Hiiu Kalur
- 3. Pärnu Tervis
- 5. Põltsamaa Sport
- 6. Kehtna Flora
