Leagues and Clubs of Slovenia1998/99
1. SNL (1. League)
- 1. Maribor Teatanic
- 2. HIT Nova Gorica
- 3. Rudar Velenje
- 4. Mura Murska Sobota
- 5. Korotan Prevalje
- 6. Olimpija Ljubljana
- 7. Publikum Celje
- 8. NK Domžale
- 9. Primorje Ajdovščina
- 10. NK Beltinci
- 11. NK Koper
- 12. Triglav Kranj
2. SNL (2. League)
- 1. NK Dravograd
- 2. Pohorje Ruše
- 3. Železničar Maribor
- 4. NK Šmartno
- 5. Tabor Sežana
- 6. Aluminij Kidričevo
- 7. Drava Ptuj
- 8. NK Zagorje
- 10. Elan 1922 Novo Mesto
- 11. Nafta Lendava
- 12. Jadran Hrpelje-Kozina
- 14. Factor Ljubljana
- 15. Slovan-Slavija Ljubljana
- 16. Rudar Trbovlje
3. SNL Center (3. League)
- 1. Livar Ivančna Gorica
- 3. Svoboda Ljubljana
- 5. NK Bled
- 6. NK Dob
- 11. Zarica Kranj
3. SNL Sever (3. League)
- 1. ŠD Rogoza
- 3. NK Šoštanj
- 7. Kovinar Maribor
- 10. ND Dravinja
- 12. Mons Claudius Rogatec
3. SNL Vzhod (3. League)
- 2. NK Veržej
- 8. NK Turnišče
- 9. Čarda Martjanci
3. SNL Zahod (3. League)
- 1. NK Korte
- 4. Jadran Dekani
- 5. Brda Dobrovo
- 8. Ankaran Hrvatini
- 9. ND Bilje
