Leagues and Clubs of Indonesia1998/99
Liga Indonesia Wilayah Barat (West) (1. League)
Liga Indonesia Wilayah Pusat (Centre) (1. League)
Liga Indonesia Wilayah Timur (East) (1. League)
Liga Indonesia Divisi Satu (2. League)
- Indocement Cirebon
- Mitra Surabaya
- Perseden Denpasar
- Persedikab Kediri
- Perserang Serang
- Persewangi Banyuwangi
- Persidafon Dafonsoro
- Persijap Jepara
- Persijatim Jakarta Timur
- Persipal Palu
- Persis Solo
- Persiss Sorong
- Persiter Ternate
- Persmin Minahasa
- PSB Bogor
- PSJS Jakarta Selatan
- PSPS Pekanbaru
- PSS Sleman
- PSSB Bireun
Liga Indonesia Divisi Dua (3. League)
unkown
- Gumarang FC
- Persekabpas Pasuruan
- Persekam Metro FC
- Persekap Pasuruan
- Persid Jember
- Persidago Gorontalo
- Persigo Gorontalo
- Persika Karawang
- Persikasi Bekasi
- Persiku Kudus
- Persim Maros
- Persipro Probolinggo
- Persipur Purwodadi
- PPSM Magelang
- PS Bangka
- PS Bengkulu
- PSBI Blitar
- PSBS Biak Numfor
- PSGC Ciamis
- PSIR Rembang
- PSKB Binjai